Mario Mutu este fiul pe care Adrian Mutu îl are din mariajul cu actriţa Alexandra Dinu. Cei doi au fost căsătoriţi între 2001 şi 2003. Ulterior, Mutu a fost căsătorit între 2005 şi 2013 cu Consuelo Matos Gómez şi au împreună două fete, pe Adriana şi Maya. În prezent, Adrian Mutu formează un cuplu cu Sandra Bachici, alături de care are un băiat, pe nume Tiago.
Mario Mutu şi-a petrecut o bună perioadă din viaţă în Italia, acolo unde a locuit alături de mama lui care l-a crescut singură. În prezent, tânărul în vârstă de 19 ani locuieşte singur în România şi a vorbit într-un interviu pentru Antena Stars despre relaţia pe care o are cu părinţii săi şi a dezvăluit dacă a resimţit o anumită presiune, având în vedere că atât Alexandra Dinu, cât şi Adrian Mutu au parte de notorietate. „E frumos dintr-un anumit punct de vedere să mă ştie lumea, dar până la urmă nu mă ajută cu nimic. Vreau să mă ştie lumea pentru ceva ce fac eu, nu pentru ce au făcut părinţii mei. Dar îmi place, sunt mândru de ei. Vreau să realizez ceva şi după să mă ştie lumea. Probabil cel mai mare avantaj este că numite persoane te respectă mai mult. Unele persoane se apropie de mine pentru cine sunt părinţii mei, am simţit chestia asta din prima. Nu am fost niciodată genul să mă dau mare cu cine e tata. Există şi dezavantaje, evenimente neplăcute întâmplate în trecut.”